janus.qmmm.OniomXS
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.. currentmodule:: janus.qmmm

.. autoclass:: OniomXS

   
   .. automethod:: __init__

   
   .. rubric:: Methods

   .. autosummary::
   
      ~OniomXS.__init__
      ~OniomXS.compute_COM
      ~OniomXS.compute_gradients
      ~OniomXS.compute_lamda_i
      ~OniomXS.compute_zero_energy
      ~OniomXS.convert_input
      ~OniomXS.define_buffer_zone
      ~OniomXS.edit_qm_atoms
      ~OniomXS.electrostatic
      ~OniomXS.find_boundary_bonds
      ~OniomXS.find_buffer_atoms
      ~OniomXS.get_Rmax
      ~OniomXS.get_Rmin
      ~OniomXS.get_buffer_info
      ~OniomXS.get_external_charges
      ~OniomXS.get_forces
      ~OniomXS.get_redistributed_positions
      ~OniomXS.get_switching_function
      ~OniomXS.get_zero_energy
      ~OniomXS.make_primary_subsys_trajectory
      ~OniomXS.make_second_subsys_trajectory
      ~OniomXS.mechanical
      ~OniomXS.partition
      ~OniomXS.prepare_link_atom
      ~OniomXS.run_aqmmm
      ~OniomXS.run_qmmm
      ~OniomXS.set_Rmax
      ~OniomXS.set_Rmin
      ~OniomXS.update_traj
   
   

   
   
   .. rubric:: Attributes

   .. autosummary::
   
      ~OniomXS.nm_to_angstrom